kvestor (z lat. quaestor; pôvodne správca štátnej pokladnice v antickom Ríme)
zodpovedá za hospodársky a administratívny chod univerzity. Je podriadený priamo rektorovi.
prorektori
zastupujú rektora v rozsahu, aký sám určí. Na SPU pôsobí päť prorektorov, každý pre konkrétnu oblasť činností (vzdelávanie, veda a výskum, zahraničné vzťahy, rozvoj univerzity, vzťahy s verejnosťou a ďalšie).
akademický senát
samosprávny orgán, ktorý rozhoduje o kľúčových otázkach činnosti univerzity. Jeho členmi sú volení zástupcovia akademickej obce, pričom najmenej jednu tretinu tvoria študenti.