Účasť na vedeckých projektoch bola hlavným cieľom dvojmesačnej stáže prostredníctvom programu Erasmus+ , ktorú som absolvoval v júli a auguste na Univerzite v Helsinkách. Projekty viedla moja miestna školiteľka doc. Kristiina Himanen.
Cieľom hlavného projektu bolo skúmanie interakcií medzi modelovou rastlinou Arabidopsis thaliana a hubou Botrytis cinerea. S cieľom naplniť túto úlohu sme sledovali vplyv inokulácie spórami húb Botrytis na listy rôznych mutantov rastlín Arabidopsis, ktoré mali mutácie sledovaných génov. Metódou bolo pozorovanie zmien na listoch pomocou RGB imidžingu, ale aj sledovanie citlivejšou metódou pomocou zachytávania fluorescenčného signálu a určenia tzv. kvantového výťažku, čo je parameter fotosyntézy, podľa ktorého sa dá citlivo určiť poškodenie alebo stres rastlín. Obe metódy využívame aj na Katedre fyziológie rastlín na SPU v Nitre.
V ďalšom projekte sme sa zaoberali údajným pôsobením syringolínu, obsiahnutého v baktérii Pseudomonas syringae, na niektoré proteíny. Gény pre skúmané proteíny boli introdukované do genómu Agrobacterium tumefaciens, ktorými boli následne infiltrované pletivá tabaku Nicotiana benthamiana. Na pozorovanie interakcie bola použitá fluorescenčná metóda – pozitívny výsledok sa prejavil fluorescenciou pozorovanou pomocou fluorescenčného mikroskopu. Výsledky oboch výskumov nám umožňujú lepšie pochopiť procesy interakcií škodcov s ich hostiteľmi, vďaka čomu budeme môcť vyvinúť nové ochranné spôsoby, ktoré by imitovali prírodné procesy a boli tak prijateľné v rámci modernej ochrany rastlín.
Okrem týchto projektov, ktoré ašpirujú na publikácie, prebiehali na danom pracovisku dva ďalšie, ktoré prevádzali moji hostitelia pre iné pracoviská v Európe, konkrétne v Lotyšsku a Estónsku. Takto som sa mohol zúčastniť aj na medzinárodných projektoch, čo bola tiež výborná príležitosť stretnúť odborníkov z iných krajín. Samozrejmou súčasťou stáže bola aj kultúrna výmena, napríklad v typických fínskych saunách, či vo forme turistiky v miestnej prírode, ktorou Fínsko hojne disponuje, dokonca aj priamo v Helsinkách.
Ing. Erik Chovanček, doktorand na Katedre fyziológie rastlín FAPZ
Infiltrácia transformovaných agrobaktérií do listov tabaku
Foto: archív ECH
