Fakulta agrobiológie a potravinových zdrojov SPU v Nitre vybudovala excelentné centrum výskumu v rámci riešenia projektov Excelentné centrum ochrany a využívania agrobiodiverzity (ECOVA) a Excelentné centrum ochrany a využívania agrobiodiverzity Plus (ECOVA Plus), podporovaných zo štrukturálnych fondov EÚ.
V rámci uvedených projektov bolo na Katedre genetiky a plemenárskej biológie (KGPB) vytvorené Laboratórium genetiky živočíchov (LGŽ) s cieľom rozvíjať vedeckovýskumné aktivity v oblasti molekulovo-genetických analýz živočíchov. Ako nás informoval doc. Ing. Juraj Candrák, PhD., vedúci KGPB, a doc. Ing Anna Trakovická, PhD., zástupkyňa vedúceho KGPB a prodekanka FAPZ, s podporou štrukturálnych fondov EÚ sa im naskytla príležitosť zaobstarať špičkové prístroje, ktoré doplnili pôvodnú prístrojovú techniku. Použitie nových prístrojov umožní zvýšiť kvalitu vedeckovýskumných projektov zaoberajúcich sa štúdiom génov a ich mutácií vo vzťahu k produkčných a reprodukčným ukazovateľom hospodárskych zvierat. Medzi špičkovú prístrojovú techniku patrí HRM analyzátor, DNA sekvenátor, hlbokomraziaci box a biohazard box. „HRM analyzátor umožňuje real -time termooptické analýzy s využitím centrifugačného rotačného systému pohybu všetkých vzoriek so stabilne zabudovanou optickou jednotkou vyznačujúcou sa vysokou optickou uniformitou a vysokou variabilitou vlnových dĺžok. Metóda HRM (High Resolution Melting) je novšia modifikácia Real-time PCR, ktorá dokáže prostredníctvom 3. generácie dsDNA interkalujúcich farbičiek merať intenzitu fluorescenčného signálu, ktorý je závislý od množstva uvoľnenej interkalačnej farbičky z dvojzávitnice DNA, pričom využíva prvotnú PCR amplifikáciu a jej kvantifikáciu pomocou Real-time PCR metódy a zvýšenie teploty. Metódu HRM môžeme použiť pri detekcii SNP alebo objavovaní nových doposiaľ neznámych genetických mutácií. Taktiež ju môžeme použiť pre štúdium somatických mutácií alebo pri stanovení metylácie CpG úsekov v molekule DNA. Genetický osemkapilárový DNA sekvenátor pracujúci na princípe kapilárnej elektroforézy nám poskytuje možnosť sekvenačných analýz (sekvenácia de novo, resekvenácia), fragmentačných analýz (detekcia heterozygotov, SNP, STR, AFLP, MLPA) a multiplexnej kvantifikácie génovej expresie. Systém disponuje univerzálnym softvérom s prídavným modulom pre pokročilú analýzu sekvenačných dát vrátene návrhu primerov, prevedenia samotnej analýzy a vyhodnotením multiplexovej génovej expresie. Hlbokomraziaci box nám poskytuje možnosť dlhodobej archivácie vzoriek biologických materiálov od -20 °C do -86 °C. Biohazard box nám zabezpečuje podmienky pre prácu s biologickým materiálom v II. triede biohazardu,“ dozvedeli sme sa od kompetentných odborných pracovníkov. Prístrojovú techniku LGŽ využívajú vo vedeckovýskumnej činnosti (na riešenie výskumných úloh prebiehajúcich domácich a zahraničných projektov základného výskumu) a vo vzdelávacom procese (pri riešení záverečných prác na II. a III. stupni vysokoškolského vzdelávania, ako aj pri praktických cvičeniach vybraných predmetov vyučovaných na KGPB). Laboratórium LGŽ, tak ako aj ďalšie laboratóriá excelentného centra FAPZ, je určené na nekomerčné vedecké účely.
Renáta Chosraviová
Laboratórium genetiky živočíchov disponuje moderným prístrojovým vybavením. Na snímke výskumná
zamestnankyňa Ing. Nina Moračíková, PhD. Foto: rch
