Fakulta biotechnológie a potravinárstva (FBP) začala svoju činnosť 1. októbra 2002. Do konca roku 2002 bola financovaná z dotačných prostriedkov z pôvodnej materskej FAPZ. Od 1. januára 2003 vstúpila do prvého samostatného hospodárskeho roka.
Podľa štatistického výkazu MŠ SR č. 11 - 01 o vysokej škole k 31. 10. 2003 študovalo v akademickom roku 2003/2004 na novej fakulte 755 študentov: na bakalárskom štúdiu 530, na inžinierskom 209 a na doktorandskom 16 študentov. Na katedrách FBP je okrem týchto doktorandov 5 interných a 14 externých doktorandov zo školiaceho pracoviska FAPZ. Plnenie hlavných a ostatných úloh fakulta zabezpečovala s 50 internými učiteľmi a 44 neučiteľskými zamestnancami, ktorí pracujú na 7 katedrách, 1 účelovom zariadení a na dekanáte FBP.
Na ekonomické zabezpečenie hlavných a ostatných úloh FBP bolo v hospodárskom roku 2003 použité viaczdrojové financovanie. V rámci dotačných prostriedkov, na základe schválenia AS SPU, bolo FBP na plnenie hlavných úloh pridelených 954 tis. Sk na bežné výdavky (BV) a 203 na kapitálové výdavky (KV), na podprogramoch 022 01 a 022 02, okrem mzdových prostriedkov. FBP bola pridelená účelová dotácia na sociálne štipendiá pre študentov vo výške 2 499 tis. Sk.
Manažment fakulty pochopil, že nevyhnutnosťou k získaniu mimorozpočtových finančných zdrojov na krytie výdavkov, predovšetkým na plnenie hlavných úloh, je práve vedeckovýskumná oblasť, kde má fakulta silný tvorivý potenciál. Týmto smerom preto zamerala svoju orientáciu a uchádzala sa o riešenie projektov a štátnych programov.
FBP v roku 2003 riešila 10 projektov VEGA a 3 projekty KEGA, na základe čoho získala 949 tis. Sk na BV a 489 tis. Sk na KV, čo je spolu 1 438 tis. Sk na podprograme 022 02. Na základe podaných rozvojových projektov fakulta získala ďalší zdroj na podprograme Rozvoj VŠ vo výške 932 tis. Sk na BV a 530 tis. Sk na KV - spolu 1 462 tis. Sk. Na podprograme 02205 - Transformácia VŠ fakulta získala 504 tis. Sk. Na príjmoch fakulta získala 5 963 tis. Sk, pričom hlavný podiel tohto finančného zdroja bol zo zapojenia sa do riešenia 2 čiastkových úloh v rámci riešenia podprogramu Potraviny - kvalita a bezpečnosť štátneho programu výskumu vývoja Kvalita života - zdravie, výživa, vzdelávanie. Ostatné mimodotačné zdroje v rámci riešenia vedecko-technických projektov a APVT boli v čiastke 532 tis. Sk. Hodnota disponibilných dotačných zdrojov na krytie bežných a kapitálových výdavkov bola, okrem mzdových výdavkov, vo výške 3 656 tis. Sk. Hodnota disponibilných mimorozpočtových zdrojov bola 9 899 tis. Sk.
Na plnenie hlavných a ostatných činností FBP využívala majetok, ktorý má v správe od SPU, vo výške 34 942 tis. Sk. Fakulta v roku 2003 nezabudla ani na aplikáciu použitia informačných a komunikačných technológií v pedagogickom procese, ako aj vo výskume. Časť získaných zdrojov použila na nákup 38 počítačov a ďalšej výpočtovej techniky na materiálno- technické vybudovanie dekanátu fakulty. Zabezpečením uvedených finančných zdrojov a zhodnocovaním majetku SPU fakulta potvrdila, že jej smerovanie na získavanie finančných zdrojov je správne. Aj tým ukázala akademickej a širokej verejnosti opodstatnenosť svojho vzniku.
Úspešné vykročenie zaväzuje FBP, aby z uvedeného trendu nezľavila, ale naopak, aby za širokej účasti svojich zamestnancov hľadala v súčasnom zložitom ekonomickom prostredí štátu a v roku vstupu do Európskej únie nové možnosti na získanie mimodotačných prostriedkov.