Prezident ČR Václav Klaus vymenoval 23. januára 2006 štrnásť rektorov českých vysokých škôl a univerzít. Do rektorskej funkcie boli po prvýkrát zvolení: prof. Lubomír Dvořák (Univerzita Palackého v Olomouci), prof. Václav Hampl (Univerzita Karlova v Prahe), prof. Jiří Málek (Univerzita Pardubice), prof. Václav Havlíček (České vysoké učení technické v Prahe), prof. Karel Rais (Vysoké učení technické v Brne), prof. Vladimír Večerek (Veterinárna a farmaceutická univerzita v Brne), prof. Jaroslav Hlušek (Mendelova poľnohospodárska a lesnícka univerzita v Brne), prof. Boris Jirků (Vysoká škola umelecko-priemyslová v Prahe) a prof. Richard Hindls (Vysoká škola ekonomická v Prahe).
V druhom funkčnom období budú v rektorskej práci pokračovať: prof. Tomáš Čermák (VŠB - Technická univerzita v Ostrave), prof. Jiří Sopko (Akadémia výtvarných umení v Prahe), prof. Václav Cejpek (Janáčkova akadémia múzických umení v Brne), prof. Jan Hron (Česká poľnohospodárska univerzita v Prahe) a prof. Vojtech Konopa (Technická univerzita v Liberci). Podľa novely vysokoškolského zákona z decembra minulého roka sa rektorské funkčné obdobie predĺžilo z troch na štyri roky.
