Poslaním Vydavateľstva SPU je organizačné zabezpečenie, príprava, vydávanie a predaj literatúry pre potreby univerzity. Ide predovšetkým o študijnú literatúru (učebnice, skriptá) vedeckú a inú odbornú literatúru (monografie, príručky, vedecké časopisy, ročenky, zborníky a odborné časopisy). VES zabezpečuje aj rozmnožovanie študijných a pracovných materiálov pre potreby jednotlivých pracovísk SPU a v prípade voľných kapacít poskytuje svoje služby iným subjektom a súkromným osobám.
V roku 2005 vyšlo vo Vydavateľstve SPU 91 skrípt, 8 učebníc (z nich jedna v elektronickej forme na CD), 17 monografií, 17 titulov z oblasti odporúčanej literatúry a príručiek, 52 zborníkov z vedeckých podujatí (z toho 22 na CD), 11 vedeckých časopisov radu Acta a 4 čísla časopisu Agrochémia. Predajná cena študijnej literatúry, ktorej výroba sa hradila z dotačných a vlastných prostriedkov, presahuje 3,3 milióna korún.
Množstvo vydávanej literatúry závisí predovšetkým od predaja, preto myšlienka "potrestať" tých, ktorí si objednali vydanie "nepredajnej" publikácie, sa v praxi ukázala ako veľmi účinná. V najbližšej budúcnosti bude rásť požiadavka na vydávanie nízkonákladovej literatúry. Jedným z riešení je vytvoriť akúsi databázu študijnej literatúry, ktorá by sa podľa záujmu študentov vytlačila, resp. uložila na požadované magnetické médium a v tejto forme sa aj predávala. Pretrvávajúcim nedostatkom niektorej študijnej literatúry je jej nevhodná štruktúra a neaktuálnosť. Univerzita a katedry by mali tomuto problému venovať väčšiu pozornosť, veď publikácie vydávané na SPU nakupujú mnohé slovenské knižnice, ale aj odborníci z praxe. Dobre napísané dielo robí dobré meno tak autorovi, ako aj vydavateľovi a naopak.