vedecká rada
samosprávny orgán univerzity pre oblasť rozvoja výchovno-vzdelávacieho procesu, výskumu, vedy a techniky. Jej členmi sú učitelia pôsobiaci vo funkciách profesorov a docentov, výskumní alebo vedúci zamestnanci a významní odborníci z oblastí týkajúcich sa vzdelávacej či vedeckovýskumnej činnosti univerzity.

správna rada
jej úlohou je posilňovať väzby univerzity a spoločnosti a presadzovať verejný záujem najmä v oblasti nakladania s majetkom a finančnými prostriedkami. Členov správnej rady na návrh rektora, resp. po jeho vyjadrení, vymenúva a odvoláva minister školstva.