Premiéru v nových ekonomických podmienkach úspešne zvládlo šesť verejných vysokých škôl. V roku 2003, keď už nemali na svoju činnosť garantovaných sto percent zo štátneho rozpočtu, skončili v pluse. Naopak, záporný hospodársky výsledok vykázalo na konci roka 13 škôl. Vyplýva to zo Správy o stave vysokého školstva za rok 2003, ktorú po prvý raz v histórii vypracovalo ministerstvo školstva. Slovenská poľnohospodárska univerzita v Nitre s kladným hospodárskym výsledkom 6,66 milióna Sk je v rebríčku najlepšie hospodáriacich vysokých škôl na druhom mieste za STU v Bratislave (29,44 mil. Sk) a pred Prešovskou univerzitou (5,15 mil. Sk).
